Fumoon parla di un pianeta Terra devastato dall'inquinamento, al punto che piante e fiori sono scomparsi, e i pochi esemplari rimasti sono talmente preziosi da esser conservati in teche protettive. Il mondo continua a inquinare e invece d'investire in risorse per il bene dell'uomo, i paesi continuano ad accumulare armi di distruzione di massa. L'inquinamento e le radiazioni hanno creato una nuova razza mutante umana: i Fumoon. Questa nuova razza vive nascosta in un'isola ed è tecnologicamente molto evoluta. Ha appreso che la Terra sta per essere investita da un vortice nero mortale e vuole fuggire portando in salvo gli animali della Terra, ma non l'uomo, essendo ritenuto un essere malvagio e imperfetto. Pur tuttavia, una ragazza della razza Fumoon scoprirà che non tutti gli uomini sono cattivi, e vorrà aiutarli.
