L'Europa intera è in allarme a causa di un gruppo terroristico che ha minato la città di Monaco (e forse anche altre città) con un ordigno nucleare e minaccia di farlo esplodere. I servizi di sicurezza riescono a bloccare Anthony Moran, uno degli esponenti di spicco del terrorismo internazionale sospettato di far parte del complotto, ma nel corso dell'azione Moran viene ferito e cade in coma. Quando si scopre che l'uomo ha nascosto all'interno del proprio corpo il minuscolo chip che funge da detonatore della bomba, collegandolo in modo da farlo scattare in caso di rimozione o di morte, i governi si affidano ad una équipe di scienziati per neutralizzarlo. E gli studiosi risolvono il problema con un ardito esperimento: nel corpo di Moran viene iniettato un sottomarino miniaturizzato, con a bordo un piccolo equipaggio che avrà il compito di guidare sul bersaglio l'ex agente del FBI Richard Gaynes (Henriksen), richiamato per l'occasione in quanto massimo esperto di esplosivi ed artificiere insuperabile. Malgrado tutta la tecnologia di cui dispongono, l'avventuroso viaggio dei micronauti sarà irto di pericoli.
